Diplômé de l'Ecole Polytechnique et de l'École Nationale des Ponts et Chaussées à Paris, Etienne Crépon a débuté sa carrière en 1993 au ministère du Logement.

Il est ensuite directeur du développement de l’établissement public d’aménagement de Saint-Quentin-en-Yvelines de 1995 à 2001.

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Il rejoint en 2002 le cabinet du ministre de l’équipement puis à partir de 2005 du ministre de l'Education nationale, de l'Enseignement supérieur et de la Recherche, en tant que directeur adjoint du cabinet chargé de l’enseignement supérieur, de la recherche et du budget.

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En 2007, il est nommé directeur, adjoint au directeur général de l’urbanisme de l’habitat et de la construction puis en 2008 directeur de l’habitat, de l'urbanisme et des paysages au ministère du Logement et au ministère du Développement durable.

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En juillet 2014, il devient président du Centre scientifique et technique du bâtiment.

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